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防污染種子貯藏前要徹底清除其中的作物莖、葉、雜草、沙子、土粒等雜物，并對貯藏室以及貯藏用具進(jìn)行嚴(yán)格的消毒。
防霉變防霉變的關(guān)鍵是要控制好種子所含的水分，禾谷類作物種子含水量應(yīng)為12%~13%，油料作物種子應(yīng)為8%～9%。
防高溫貯藏種子的環(huán)境溫度最好在10℃左右，切忌把種子放在距火爐較近的地方。
防潮濕裝種子的袋子不宜直接放在地上，應(yīng)用磚石或木板墊高50厘米以上。貯藏室要注意通風(fēng)換氣。
防窒息種子不能用塑料袋貯存。
防腐蝕種子不能與農(nóng)藥、化肥等同室存放。
防煙熏煙氣較大的房間（如廚房）不能存放種子，貯藏室也不宜靠近廚房。
防蟲鼠害蟲、老鼠不僅會直接吃掉種子，而且還會污染種子，使種子變質(zhì)，發(fā)芽率降低。因此，要采取相應(yīng)的措施消滅害蟲和老鼠。
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